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如果你認(rèn)為你自己沒(méi)有病毒，那么請(qǐng)?jiān)傧胍幌搿?/span>
這可能是很難理解的：人體被大量的微生物所占據(jù)，這些微生物通常被稱(chēng)為我們的微生物組（microbiome），自從人類(lèi)早期就與我們一起進(jìn)化。科學(xué)家們近才開(kāi)始對(duì)微生物組進(jìn)行定量檢測(cè)，并發(fā)現(xiàn)它至少存在38萬(wàn)億個(gè)細(xì)菌[1]。或許更有趣的是，細(xì)菌不是生活在我們的體內(nèi)和體表上的豐富的微生物。病毒才是如此。
我們體內(nèi)外的每個(gè)表面都被微生物---細(xì)菌、病毒、真菌和很多其他的微觀的生命形式---覆蓋著。圖片來(lái)自vrx/Shutterstock
據(jù)估計(jì)，我們的身體中有380萬(wàn)億多個(gè)病毒[2]，這些病毒群體統(tǒng)稱(chēng)為人體病毒組（human virome）。不過(guò)這些病毒并不是你經(jīng)常聽(tīng)到的危險(xiǎn)病毒，比如導(dǎo)致流感或普通感冒的病毒，或者像埃博拉病毒或登革熱病毒那樣的更險(xiǎn)惡的病毒。很多病毒能夠感染生活在你體內(nèi)的細(xì)菌，它們被稱(chēng)為噬菌體。人體是噬菌體的滋生地，而且盡管它們很豐富，但是我們對(duì)身體中的它們和任何其他的病毒的作用都知之甚少。
附著到細(xì)菌細(xì)胞壁上的多個(gè)噬菌體的透射電子顯微圖，圖片來(lái)自Dr. Graham Beards, CC BY-SA。
作為一名研究人類(lèi)微生物組的醫(yī)生科學(xué)家，我專(zhuān)注于病毒研究，這是因?yàn)槲蚁嘈爬眉?xì)菌的天然捕食者的力量將教會(huì)我們?nèi)绾晤A(yù)防和對(duì)抗細(xì)菌感染。人們可能想當(dāng)然地認(rèn)為，如果病毒是體內(nèi)豐富的微生物，那么它們將成為大多數(shù)人體微生物組研究的目標(biāo)。但是這種假設(shè)是非常錯(cuò)誤的。迄今為止，對(duì)人體病毒組的研究滯后于對(duì)細(xì)菌的研究，我們?nèi)缃癫艅倓偘l(fā)現(xiàn)了它們的一些基本的特征。這種滯后是由于科學(xué)家花了很長(zhǎng)時(shí)間才認(rèn)識(shí)到人體病毒組的存在，以及缺乏標(biāo)準(zhǔn)化和復(fù)雜的工具來(lái)破解人體病毒組中到底有什么。
關(guān)于病毒組的信息（The 411 on the virome, 注：411指的是美國(guó)電話查詢(xún)號(hào)碼，這里指有關(guān)某人或某事的信息）
這是我們迄今為止了解到的一些知識(shí)。人體中的細(xì)菌并不喜歡生活在它們內(nèi)部和周?chē)脑S多噬菌體。事實(shí)上，它們產(chǎn)生了CRISPR-Cas系統(tǒng)---人類(lèi)如今已將它用于編輯基因[3]---來(lái)讓它們自己擺脫噬菌體或*阻止噬菌體感染[4]。為什么？這是因?yàn)槭删w會(huì)殺死細(xì)菌。它們會(huì)接管細(xì)菌中的分子機(jī)器并迫使它們產(chǎn)生更多的噬菌體，而不是產(chǎn)生更多的細(xì)菌。當(dāng)這一切完成后，它們會(huì)從細(xì)菌中爆裂出來(lái)并將其摧毀。后，噬菌體位于我們的身體表面，等待著細(xì)菌獵物的出現(xiàn)[5]。它們實(shí)際上就是細(xì)菌跟蹤狂。
很明顯，每天每分鐘都有噬菌體和細(xì)菌之間的戰(zhàn)爭(zhēng)在我們的身體上展開(kāi)，而且我們不知道誰(shuí)會(huì)贏，也不知道這場(chǎng)戰(zhàn)爭(zhēng)的后果可能是什么。
病毒可能棲息在人體內(nèi)外的所有表面上。在研究人員在人體內(nèi)觀察到的任何地方，都能發(fā)現(xiàn)病毒的蹤跡。血液中存在病毒嗎？存在。皮膚上存在病毒嗎？存在。肺部中存在病毒嗎？存在。尿液中存在病毒嗎？存在。等等。簡(jiǎn)而言之，當(dāng)談及病毒在人體中存在的地方時(shí)，相比于問(wèn)它們?cè)谀男┑胤酱嬖赱6]，弄清楚它們?cè)谀男┑胤讲淮嬖谑且粋€(gè)好得多的問(wèn)題。
病毒具有傳染性。但是我們常常認(rèn)為噬菌體不容易傳播。研究人員已證實(shí)僅與某人生活在一起，就能夠快速地傳播你體內(nèi)的噬菌體到對(duì)方身上[7]。如果我們不知道細(xì)菌和病毒在我們身體中的持續(xù)戰(zhàn)斗的后果是什么，那么考慮到你體內(nèi)的細(xì)菌和病毒之間的爭(zhēng)斗以及它們隨后會(huì)傳播到包括你的配偶和你的室友在內(nèi)的任何人，甚至你的狗中，事情將會(huì)變得更加復(fù)雜。
病毒讓我們保持健康？
終，我們需要知道人體內(nèi)所有這些病毒的作用，并弄清楚我們是否能夠利用我們的病毒組來(lái)促進(jìn)我們的健康。但是，目前可能還不清楚為什么沒(méi)有人會(huì)相信我們的病毒組可能是有益處的。
這可能似乎是違反直覺(jué)的，但是破壞我們體內(nèi)的細(xì)菌可能對(duì)我們的健康是有害的[8]。比如，當(dāng)我們體內(nèi)的健康細(xì)菌群落受到抗生素使用的干擾時(shí)，其他的不好的微生物（也稱(chēng)為病原體）利用這個(gè)機(jī)會(huì)侵入我們的身體并讓我們生病。因此，在許多人類(lèi)條件下，我們的健康細(xì)菌在預(yù)防病原體入侵中起著重要的作用。這就是病毒的用武之地。它們已經(jīng)想出了如何殺死細(xì)菌。這就是它們的生活。
因此我們致力于在我們的病毒組中發(fā)現(xiàn)那些已找到了如何保護(hù)我們免受不好的病原體傷害的病毒，同時(shí)讓有益的細(xì)菌保持完好無(wú)損。事實(shí)上，近有一些類(lèi)似傳聞的例子利用噬菌體成功地治療對(duì)大多數(shù)（如果不是全部）抗生素產(chǎn)生抗藥性的危及生命的細(xì)菌感染[9]---這種療法稱(chēng)為噬菌體療法（phage therapy）。不幸的是，鑒于人們并未充分地了解噬菌體如何在人體中發(fā)揮作用以及引入它們可能對(duì)人類(lèi)宿主產(chǎn)生不可預(yù)見(jiàn)的后果，這類(lèi)療法的應(yīng)用已經(jīng)并將繼續(xù)受到阻礙。因此，噬菌體治療仍然受到嚴(yán)格監(jiān)管。按照目前的研究速度，將噬菌體作為一種經(jīng)常使用的抵抗細(xì)菌感染的療法可能需要很多年的時(shí)間。但別搞錯(cuò)了；這些與我們一起進(jìn)化多年的病毒不僅是我們過(guò)去的一部分，而且將在未來(lái)的人類(lèi)健康中扮演重要角色。（生物谷 ）
本文譯自The Conversation新聞：Meet the trillions of viruses that make up your virome，原作者為美國(guó)加州大學(xué)圣地亞哥分校微生物學(xué)副主任David Pride和美國(guó)洛克菲勒大學(xué)訪問(wèn)學(xué)者Chandrabali Ghose，由生物谷編譯。
資訊出處：
Meet the trillions of viruses that make up your virome
參考資料：
1.Ron Sender et al. Revised Estimates for the Number of Human and Bacteria Cells in the Body. PLoS Biology, 19 August 2016, doi:10.1371/journal.pbio.1002533
2.John LMokili et al. Metagenomics and future perspectives in virus discovery. Current Opinion in Virology, February 2012, doi:10.1016/j.coviro.2011.12.004
3.Patrick D. Hsu et al. Development and Applications of CRISPR-Cas9 for Genome Engineering. Cell, 5 June 2014, doi:10.1016/j.cell.2014.05.010
4. Rodolphe Barrangou et al. CRISPR Provides Acquired Resistance Against Viruses in Prokaryotes. Science, 23 Mar 2007, doi:10.1126/science.1138140
5.Jeremy J. Barr et al. Bacteriophage adhering to mucus provide a non–host-derived immunity. PNAS, 25 June 2013, doi:10.1073/pnas.1305923110
6.Shira R.Abeles et al. Molecular Bases and Role of Viruses in the Human Microbiome. Journal of Molecular Biology, 25 November 2014, doi:10.1016/j.jmb.2014.07.002
7.Melissa Ly et al. Transmission of viruses via our microbiomes. Microbiome, 2 December 2016, doi:10.1186/s40168-016-0212-z
8.Vincent B Young. The role of the microbiome in human health and disease: an introduction for clinicians. BMJ, 15 March 2017, doi:10.1136/bmj.j831
9.Robert T. Schooley et al. Development and Use of Personalized Bacteriophage-Based Therapeutic Cocktails To Treat a Patient with a Disseminated Resistant Acinetobacter baumannii Infection. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, September 2017, doi:10.1128/AAC.00954-17
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